FDA และ USDA เป็นหน่วยงานกำกับดูแลที่ดำเนินการตรวจสอบเพื่อดูว่าโรงงานแปรรูปอาหารปฏิบัติตามกฎที่กำหนดโดยรัฐบาลกลางหรือไม่ หน่วยงานเหล่านี้มักไม่ดำเนินการตรวจสอบ การตรวจสอบมักดำเนินการโดยบุคคลที่สาม บริการอาหาร และเหตุผลในการตรวจสอบขึ้นอยู่กับว่าใครเป็นผู้ดำเนินการ ผู้แปรรูปอาหารสามารถจ่ายเงินให้บุคคลที่สามเพื่อดำเนินการตรวจสอบสถานที่ของตนเพื่อให้ได้รับการรับรองด้านความปลอดภัยและคุณภาพ การรับรองจากบุคคลที่สามเหล่านี้มักเป็นข้อกำหนดของลูกค้า องค์กรที่ได้รับการยอมรับซึ่งดำเนินการตรวจสอบดังกล่าว ได้แก่Safe Quality Food Institute (SQF) มาตรฐานสากลจากBritish Retail Consortium (BRC) Global Food Safety Initiative (GFSI) และNSF InternationaรวมถึงISO Certification