โครงสร้างหลายอย่างในสมองเกี่ยวข้องกับการนอนหลับ ภาพ กราฟิกสมองแสดงกายวิภาคของการนอนหลับ ไฮโปทาลามัสซึ่งเป็นโครงสร้างขนาดเท่าเมล็ดถั่วที่อยู่ลึกเข้าไปในสมอง มีกลุ่มเซลล์ประสาทที่ทำหน้าที่เป็นศูนย์ควบคุมที่ส่งผลต่อการนอนหลับและการตื่นตัว สมอง ภายในไฮโปทาลามัสคือนิวเคลียสซูปราเคียมาติก (SCN) ซึ่งเป็นกลุ่มของเซลล์หลายพันเซลล์ที่รับข้อมูลเกี่ยวกับการรับแสงโดยตรงจากดวงตาและควบคุมจังหวะพฤติกรรมของคุณ บางคนที่มีความเสียหายต่อ SCN นอนหลับไม่สม่ำเสมอตลอดทั้งวันเนื่องจากไม่สามารถจับคู่จังหวะของวงจรชีวิตกับวงจรสว่าง-มืดได้ คนตาบอดส่วนใหญ่รักษาความสามารถในการรับรู้แสงและสามารถปรับเปลี่ยนวงจรการนอน/ตื่นได้