มีการรักษาสเต็มเซลล์หลายประเภท รวมถึงการรักษาสเต็มเซลล์จากน้ำคร่ำและการรักษาสเต็มเซลล์จากสายสะดือ การรักษาด้วยสเต็มเซลล์ที่ได้รับการอนุมัติโดย สเต็มเซลล์ FDA ที่พบมากที่สุดคือการปลูกถ่ายเซลล์ต้นกำเนิดเม็ดเลือด ซึ่งรักษามะเร็งเม็ดเลือด เช่น มะเร็งเม็ดเลือดขาว สเต็มเซลล์ยังสามารถเป็นการบำบัดแบบฟื้นฟูสำหรับผิวหนังไหม้อย่างรุนแรงและกระจกตาที่เสียหายอย่างรุนแรง